新增6号线一期 共有27个站点
新增的6号线一期线路全长44.5km，共有27个站点。6号线一期的27个站点分别是:林埭 、林埭东、马銮西、马銮中心、陈井、西滨路口、明达、内茂、董任西、集美中心、棕榈城、华侨大学、苏厝北、霞梧、集安广场、 磁窑、洪塘、官浔、西柯、同安新城、后吴、西湖村、集安路口、新民镇、安溪路口、小西门、影视城，并预留了向漳州角美延伸条件（最终方案以批复为准）。
6号线一期平均站间距1693m，全地下敷设。马銮停车场位于海沧区，占地面积约20公顷。顶山头车辆段位于同安区，占地面积约32公顷。东溪停车场位于同安区东溪以北、五显中路以南、东海学院以东，占地面积16.6公顷。
4号线增加西延段
全线共18个站点
此次的一个变化是，地铁4号线增加了西延段。即增加了从厦门北站以西至海沧港区的一段。4号线的起终点变为嵩屿码头和翔安机场站。线路全长为69.6km。其中，马銮湾以北至厦门北站以西、大帽山以东至翔安机场以西高架敷设，高架段长度约38.4km，其余为地下线，共设站18座，其中高架车站10座，平均站间距4094m。
4号线设后溪车辆段、海沧临港停车场、蔡厝停车场，其中后溪车辆段位于线路中段，后溪以西、福厦铁路以北、集美北大道与315乡道交叉口以东；海沧临港停车场位于线路西段，厦蓉高速以北、海景路以西、南海路以东；蔡厝停车场位于线路东端，设在蔡厝综合维修基地内，与3号线共址。
2号线一期车站增至23个
二期将设站9座
2号线一期（芦坑站——五缘湾站）的线路由原本规划的25.2km调整至26.10km，车站数量由19座增至23座。调整后的2号线一期工程维持东西走向不变，敷设方式维持全地下线。调整后取消芦坑车辆段，岛内浦东停车场由线路东侧调整至西侧，更名为高林停车场（暂定名）。
2号线二期（天竺山站——芦坑站）线路长度15.53km，设站9座，平均站间距1726m。东孚车辆段选址位于海翔大道以北、龙厦与厦深走廊以南、孚莲路以东和过云溪以西的地块内，占地面积约26.6公顷，现状为民居、工厂和农田。
