7月15日至16日，南方科技大学第一届理事会正式成立，并召开了第一次会议。南方科技大学(筹)、政府、教育界、企业界共20名理事参会。南科大第一届理事会理事长由市委副书记、市长许勤担任，副理事长由市委副书记王穗明、副市长吴以环、省教育厅副厅长魏中林担任，秘书长由市政府秘书长李平担任。
覃正是深圳市委组织部5月份公布的南科大正局级副校长职位九名考察对象之一。公开资料显示，覃正1958年2月生，博士，教授，获聘南科大副校长前任上海财经大学信息管理与工程学院院长。
副校长主管后勤基建
昨日，朱清时在深圳录制湖南卫视《岳麓实践论》节目时说，在本次副校长的选拔过程中他一直都在参与，学校给覃正的初步分工是主管后勤、基建，“希望他能投身这些完全服务性的工作中，而不要牵挂他的专业”。
此前南科大两名“局级副校长”的选拔曾引发热议。昨日朱清时再次澄清，他确曾给政府写信提到学校两名行政副校长由政府委派，主要负责跟政府的沟通，但他没想到会配备“局级干部”。目前只聘任了一位副校长。7月1日生效的南科大管理临时办法已经明确，接下来副校长的选拔将由南科大发布广告，由国内外各高校推荐，南科大筛选后交理事会讨论。最后由校长提名，理事会任命。
“内地终于有一所大学由理事会来领导”
朱清时说，前日的理事会会议是“最纠结的一天”。朱清时认为这是中国教育史上一件大事，内地终于有一所大学由理事会来领导，“理事们对办学方针和规划，从自身的经验和认知来提问，绝大多数是善意的。但也有一些纠结在次要问题上，需要我们逐个解答，大大透支了精力。”
不过他认为这是一个学习的过程，“可能要过很多年以后，大家才知道怎么组织理事会，理事应该有怎样的职责和准备，在理事会上应该怎么发问等等”。
南科大首任理事长由深圳市市长许勤担任的消息在网络上引起“围观”，不少人认为这是对南科大“去行政化”理念的否定，但朱清时强调，这是中国现实下的一种必要的选择。如果不由市长当理事长，理事会的权威可能有所削弱，“它的决议市政府承认吗？比如南科大的预算，理事会通过后政府同不同意？财委认不认账？所以还是由市长当(理事长)，这是目前必要的一步。改革不可能一步到位。”
对话朱清时
“如果知道会出现这么多的困难，当时绝不会答应”
昨日，朱清时在深圳为湖南卫视《岳麓实践论》录制了一期节目。现场播放的两年前朱清时踌躇满志的视频，反衬出当下这位老者的清瘦、焦虑与忧愁。
主持人：最开始请你来当南科大校长，你是很犹豫的。现在后悔了吗？
如果知道会出现这么多的困难，当时绝不会答应。但是已经走到这一步，我绝不会放弃。最近我看了笑蜀的一篇评论，说南科大校长朱清时“终于要求我们宽容改革者，这种要求很悲凉”，我看到这段话，眼泪都快流出来了。改革当中会出现各种事情，包括改革者会出现失误。南科大的改革尤为困难，有些事对我本人以及南科大的伤害很深。出现这种事情，怎么办呢？只能请大家对改革应该宽容。
主持人：你有没有考虑过退出？
朱清时：我认真思考过，如有适当的人选并被接受的话，我就隐退了。但在没有找到合适人选之前，再困难我都要坚决顶住。
主持人：有人批评你太过高调。
朱清时：我到深圳后发现处于尴尬境地，南科大的工作非常难开展。怎么办？只有一个选择：告诉社会我们想怎么办，希望大家给我们一个生存权，让我们做实验。现在还有人认为我说得太多，得罪了不少人，但如果我不说，根本连生存机会都没有。
主持人：港科大三教授的理念是“无制度设计，不足以谈改革”，你觉得他们的观点有可取之处吗？
朱清时：我很赞赏他们关于制度建设的思想。他们坚持把所有规章制度定好，而我认为要等骨干教授到位后再确定。学校的制度一定要自己的教授参与制定才行，因为他们的身家性命都在南科大，才能把学校的事情考虑得很深层。我的失误就是过多依靠他们(港科大三教授)了，没有迅速把学校的队伍建起来。这次对我的教训很深刻，让我下定决心，一定要赶快建立自己的学术队伍。所以这两个月主要精力都在这里。
主持人：外界一直说南科大的工资非常高，比如领军教授年薪可达到115万元。
朱清时：其实这个水平相比香港的教授还是比较低的。115万元的收入，税收就要扣掉40%，还要交各种保险、养老金。我觉得那些真正优秀的一流人才，你让他降低很多薪水来深圳创业是很难的。
问题在于，很多部门不知道这种薪酬的合理性在哪。他们不知道这些人在世界上就值这个价。这是南科大面临的新问题。
