据台湾《联合报》报道，水淹灾后4天，台南学甲、嘉义东石、布袋、义竹等地区仍泡在水里，重创当地畜牧养殖业。台湾“农委会”估计，中秋节台湾肉品供应没问题，但节前将有一波猪肉、鸡肉、鸡蛋涨价的压力。
据了解，此次台湾南部水灾导致猪死亡超过7300头，鸡死亡超过11万只。
台湾“农委会”畜牧处副处长王忠恕表示，中元节到中秋节期间原本就是台湾畜禽产业消费淡季，现在死了7000多头猪，约是1天毛猪交易量1/3，中秋烤肉肉品供应应该不是问题，主要是有外购肉品可替代。
他指出，中秋节是9月24日，但中秋前一周约9月10日左右毛猪供应会出现延迟，将有一波价格上涨压力；另外，土鸡原本就很贵了，加上这次水灾，蛋鸡死伤惨重，还有即将开学的影响，蛋品需求量大增，现在台湾鸡蛋价格原本就在高点上，紧接着，鸡蛋涨价压力更大。
此外，嘉义东石、布袋、义竹等地区渔业被重创，不少鱼塘积水未退或溢出，分不清楚哪里是道路、哪里是鱼塘，包括虱目鱼、吴郭鱼、金目鲈、鳗鱼等损失至少超过3亿元新台币。
业者表示，以上还只是台湾官方统计，因鱼塘灾情太严重，养的乌鱼、台湾鲷鱼等跑了不少，台南地区有台湾鲷鱼池几乎鱼跑了8成，现阶段水还没有退，没办法评估损失。
