拒绝与本地运动会合作，却忙着联手日本东京奥运会举办展览，台北故宫博物院此举在岛内引发批评。
第29届夏季世界大学生运动会将于8月在台北举办，岛内认为这是传播台湾文化观光的好机会。据联合新闻网14日报道，“立委”吴思瑶在脸书称，台北市政府曾向台北故宫提出许多合作计划，包括选手门票优惠、开发周边商品等，但频频遭到拒绝。而2020年东京奥运会的待遇大不相同，台北故宫正积极与日本洽谈合作，希望把典藏品送到日本展览。吴思瑶称，将有1.2万名世界各地选手来台参加比赛，推广台北故宫展览与文物可吸引游客来台观光，其实也是故宫的本业，“不懂得近水楼台先得月，反而国外的月亮比较圆”，根本是本末倒置，“充分暴露故宫自我的本位主义”。
台北故宫博物院院长林正仪回应称，他不知道跟大运会合作的详细情形，会再跟台北故宫的策展小组讨论，绝对不会将台湾摆在最后。虽然大运会距开幕只剩5个月，但台北故宫会再全力与台北市沟通，看看能提供什么协助。台湾“中央社”称，2014年台北故宫曾在东京、九州举办“神品至宝展”，当时在东京就有80万人次参观。2020年，台北故宫计划再和东京、九州博物馆联合策划展览，预计可能展出日方希望看到的北宋画家郭熙的《早春图》。
台北故宫近来争议不断，前几日因画展改名一事被指“去中国化”，游客日渐减少也是巨大的挑战，2016年的总参访人数较前一年少了60万人。
此外，故宫南院的访客也不理想。“中时电子报”称，南院5日落幕的“日本美术之最”特展，3个月只吸引了10万人次，平均每天只有1000人参观，与20万访客的预期落差很大。台北故宫如果对中华文化的认同无法定位，也就难以避免南院难聚人气而沦为“蚊子馆”的命运。
