吴茂昆说：“本部没有干预大学自主，而是基于捍卫大学自治，将全案退回到台大遴委会。若遴委会拒绝重启遴选，台大校长应该召开正式校务会议解决。”“大学校长遴选不像选举，不是像中央选举委员会那样，选出来就要通过，遴选是要经过资格审查，并找出最合适领导大学的人。大学最重要的是‘学生’，保护学生的受教权是教授的责任。“教育部”的责任是代表全民监督大学的运作，《大学法》也明定，大学遴选出校长后‘由教育部聘任之’，所以教育部在任用之前，必须检视是否合法或是否适合。”
吴“部长”秉承上意，断然“拔管”，还说是为了捍卫大学自治，并且提醒大家“教育部”才是最高权威，大学自治也得听咱这个“部”的话！一番扭曲事实、强词夺理的话恐怕无法令绝大多数的台湾人信服。吴茂昆力求表现，强势“拔管”，而且拔得彻底：逼着“台大校长遴选委员会”吞下原来的决议。台湾的舆论界对这件事的意见很大，批判吴“部长”的短讯，在台湾传遍。
目前已有几位遴选委员对此非常厌倦，表示要退出这个委员会。然而吴“部长”不在意，这个年头想趋炎附势、巴结执政当局的人不少，包括了知识分子、学者、教授，他根本不担心会找不到乖乖听话的遴选委员。
当事人管中闵发表感想，他说：“面对这三个多月来的种种风雨，我能坚持到今天，为的是要守护两个核心价值。一个是大学自治与学术自由；另一个是，想让台湾走出重复循环的困境。我从校长遴选期间就在谈我的治校理念；当今的台湾信任崩坏、分裂内耗、价值混乱；台湾现在最需要的，首要是找到重建社会信任机制的起点，要从民间路线、从下而上重新建立起一个社会信任的机制，它是一项社会工程。”
然而从这次“拔管”事件来看，目前台湾的执政者，根本没有将台湾的大学自治和学术自由当作一回事，大学自治如果与他们的政治目标相违背，执政者便毫不迟疑地一举将它毁掉。管教授担心台湾的分裂内耗、价值混乱，但是绿营诸公根本没有这个忧虑；他们自认是“正义”的化身，成立了一个“转型正义委员会”，大家必须跟着他们走，违背他们或看不顺眼的人随手扣上顶“不正义”的帽子，逼着下台鞠躬。“管爷”为台湾的未来担心，指出执政者任性恶搞，民众对当局不再信任、整个社会失去核心价值，台湾将逐步“崩坏”。
然而台湾的执政者继续认为：自己的选票仍然稳固，只要每次选举都能赢得多数，就可以痛痛快快地继续玩下去，你又能把他们怎么样呢？(唐荒 资深政论家)
