李登辉无意改善两岸关系。在美国的支持下，1995年6月，他到母校美国康奈尔大学访问，表示要“向不可能的事物挑战”，要争取台湾的国际生存空间。为了防止李登辉在1996年台湾第一次“总统”直选后宣布“台湾独立”，大陆在台湾海峡举行导弹试射和军事演习。
2000年5月，代表民进党的陈水扁上台后，拒不承认“九二共识”，挑衅大陆，无意缓和两岸关系。大陆坚持“听其言、观其行”。2005年3月14日，全国人民代表大会通过审议，高票通过了《反分裂国家法》，明确规定台湾问题是中国的内政，为今后采取各种方式维护台湾作为中国一部分的地位，解决台湾问题提供了法律依据。
大陆适时推动两岸政党交流。2005年4月29日，时任中共中央总书记的胡锦涛在人民大会堂会见了国民党主席连战。双方就促进两岸关系改善和发展的重大问题及两党交往事宜交换意见，坚持“九二共识”、反对台独，共同发布“两岸和平发展共同愿景”的新闻公报。
2008年5月，代表国民党的马英九上台后，兼任国民党主席，反对台独，坚持“九二共识”。大陆顺势而为，坚持推动两岸关系的和平发展，大陆海协会与台湾海基会恢复商谈。
2008年12月31日，在纪念《告台湾同胞书》发表30周年座谈会上，胡锦涛全面阐述了对台工作的大政方针，提出发展两岸关系的指导性意见，在坚持一个中国的基础上，更加灵活而务实。
化解历史分歧，铸剑为犁，是两岸人民的共同期盼。习近平总书记曾在福建工作多年，与台胞接触频繁。他从中华民族的整体利益出发，强调“两岸一家亲”，“着眼长远，两岸长期存在的政治分歧问题终归要逐步解决，总不能将这些问题一代一代传下去”。2015年11月7日下午，中共中央总书记、国家主席习近平同台湾方面领导人马英九在新加坡会面。就进一步推进两岸关系和平发展交换意见。这是1949年以来两岸领导人的首次会面。
