《海峡两岸经济合作架构协议》（ECFA）前景堪忧，一旦中止势必对岛内农渔产业造成冲击。屏东县琉球区渔会直言，大陆是台湾渔产品最重要的市场，若在清单中遭除名，“台湾渔业肯定完蛋”；云林县农会也认同说，停掉ECFA，对台湾农业的冲击非常大。另有释迦农怒批，前“农业部长”陈吉仲2年前说鸡蛋别放同一篮子，如今也没看到其他篮子，只希望下任“农业部长”别再乱搞。
据中国时报报道，台“农业部”官员洪晓君表示，大陆在ECFA的早收清单给予台湾18个税项农渔产品零关税优惠，如果大陆采取中止或部分暂停ECFA，石斑鱼、秋刀鱼、虱目鱼、兰花、茶叶、哈密瓜等品项就会恢复原本10％至20％不等的进口关税。洪晓君称，今年1到8月18项早收清单输出大陆部分，外销金额仅1400多万美元，假如要缴关税，换算下来才200多万，加上台湾农贸外销市场已逐步转移，影响有限。
不过，屏东县琉球区渔会首席专业顾问蔡宝兴直言，现在鲔鱼价格狂跌4成，高雄还传有大船准备解体、东港陆续有延绳钓渔船预备停航不作业，足见目前台湾渔业相当低迷，若明年又丧失ECFA保护，绝对一蹶不振。
李姓渔民怒诉，“除非改朝换代，否则无解”，渔民声音在蔡英文执政下愈来愈听不见，说了也没人理，甚至还会被扣帽子。
台南县区渔会总干事陈崇德则表示，台南虱目鱼从今年初至今价格稳定，以内销为主，已很久没有看到外销到大陆，在岛内没有产销失衡情况下，ECFA若中止，对虱目鱼养殖产业影响不大。
云林县渔民指出，台湾内销市场有限，大陆市场很大，打开大陆市场配合内销，渔产价格才会比较稳定。
农业方面，云林县农会总干事陈志扬表示，台湾销往大陆的农产品数量很多，之前大陆暂停台湾凤梨、芒果输入，造成农民不小损失，希望执政者不要轻忽。
台东县农会理事长、县议员杨招信说，其他农渔产都还好，台东最担心的就是产值10亿新台币的释迦，整个产业链包括数万人生计，希望民进党当局重视农民。
台东农友忧心，卡了关税、贸易商成本提高，未来盘商收购价格恐压得更低。释迦农怒批，民进党当局非要忽略大陆市场，陈吉仲2年前说鸡蛋别放同一篮子，如今也没看到其他篮子，只希望下一任“农业部长”别再乱搞。
