据台湾《中时新闻网》报道，被视为台湾这次防疫破口的“3+11”爆内幕，台“中央”流行疫情指挥中心专家咨询小组成员、台大感染科医师李秉颖指出，“3+11”政策没经专家小组讨论，完全是指挥中心可自行决定。指挥官陈时中7日表示，自己会负最后的责任，“但若要一件一件会议都公布，我实在是没办法，这一年来每天要开的会太多，要决定的事情太多。”台北市长柯文哲直言，做这项决策，若没有公卫专家的背书，就严重了，“死了700多人你要负什么责任”。
据报道，陈时中表示，当时也经大规模PCR检验，共6000多人都是阴性，因此考虑在管理上轨道后，逐步放松检疫措施，但最后还是比原来的方案严格。毕竟机组员肩负岛内经济，有货运上的必要性，工作上也相当辛苦。
陈时中强调，这些过程他都在“立法院”报告过，自己就是负最后的责任，但若要每一场会议都拿来检讨，真的是没有办法。
柯文哲表示，没有会议记录实在太扯了，这就是有问题，“执政”最后就是傲慢甚至暴力，很明显3+11违反医学，病毒潜伏期就是比3天还长，那从14天最后变成3+11，会议记录谁通过?没有人要认账。“我猜从张上淳底下，没有一个人愿意签字。”柯文哲指出，我如果是医生，我也不肯背书，那若没有问过专家医生，到底是谁决定的?
柯文哲认为，当初从武汉与纽约回来标准不一，这是哪门子的防疫，根本两套标准，而他认为是违反科学，就被称逆时中。
