傅崐萁希望恢复国民党党籍案，因为马英九系统金溥聪、徐巧芯等开记者会出面力阻而告中止。过程中，国民党考纪会主委魏平政辞职，原订于18国民党“中常会”以“无重大事项讨论”为由停开。有分析指出，这都是源于傅崐萁与国民党花莲地方党部及马英九系统的恩怨导致的。
左徐巧芯 右傅崐萁
傅崐萁与国民党地方的恩怨溯及2004年，当时傅崐萁代表亲民党与花莲前县长王庆丰之子王廷升、民进党卢博基角逐2席区域“立委”，由于泛蓝分裂（王廷升、锺逸文皆以无党籍参选），傅、卢当选；2005年傅崐萁代表亲民党竞选花莲县长，不敌国民党谢深山而败选，2008年傅连任“立委”成功，因而与国民党地方党部结怨。
马英九和傅崐萁的恩怨始于2009年10月。当时傅已入国民党，未获提名却打着党旗名号参选花莲县长遭开除党籍，但傅当选。当年国民党在县市长的席次比2005的14席掉了花莲、宜兰2席，外界质疑马英九颜面尽失。
2009年底，金溥聪接任党秘书长，任务是2010年底“五都”（台北、新北、台中、台南、高雄）选举，要保住“三都”（台北、新北、台中），金不愿与地方派系妥协，虽然达标，但“五都”总票数少于民进党。
同年底，有案在身的傅崐萁为保住花莲县长职位，与太太徐榛蔚离婚并派任徐为副县长，遭台行政机构撤销徐的人事任命，检方并依伪造文书罪（假离婚）起诉傅、徐二人，花莲地方法院分别判处二人有期徒刑6个月和4个月，均得易科罚金，台“监察院”再开罚100万元新台币，当时傅崐萁反击称“司法构陷”。
2010年2月花莲县“立委”补选，国民党推王廷升，傅昆萁挺无党籍施胜郎，当时金溥聪亲赴花莲辅选至少4次，每次都批施是黑道曾受管训，批傅是“打着蓝旗扯国民党后腿”，后来王当选，傅崐萁与金溥聪结下梁子。
2012年，王廷升争取“立委”连任，傅昆萁推嫡系张志超参选；另外，当时氛围民进党蔡英文可能赢马英九，地方传出傅要马先到花莲县政府会合，2人再与王廷升 “3人合体”象征泛蓝大团结，条件是恢复傅崐萁的党籍。
当时另传，傅昆萁还通过当任立法机构负责人的王金平向党中央“沟通”，但马英九、金溥聪及国民党中央党部都质疑傅居心叵测而拒绝，马、金并以傅官司缠身（炒股案）、社会形象不佳、花莲地方反弹等理由，未答应恢复傅的党籍。但选举关键时刻，傅仍出席时任国民党主席吴伯雄出面的造势活动，表态挺马。
2016年国民党大败后，傅崐萁想恢复党籍却始终绕不过花莲县党部这一关。傅当初是花莲黄荣华党部（黄复兴党部的支党部）通过撤销党籍，得由黄荣华党部召开考纪会与国民党花莲县地方党部委员会通过恢复党籍案，再送党中央考纪会及“中常会”同意、追认，但当时在花莲县地方党部反对傅崐萁的人都未接获开会通知的情况下，通过了傅的恢复党籍案，全案出现严重瑕疵。
2018年9月12日傅昆萁因炒股案判决8个月徒刑定谳，2019年4月18日刑满出狱，傅与太太、花莲县长徐榛蔚在国民党时任“立委”沈智慧陪同下，拜会党主席吴敦义，当时“组发会”主委李哲华出面力阻，要傅循地方党部路径让程序完备，傅黯然离去。
2020年1月11日吴敦义为败选下台，1月15日林荣德代理国民党主席，傅崐萁疑再度绕过花莲县地方党部，2月14日由黄荣华党部无异议通过傅的恢复党籍案直送国民党中央，而代理党主席林荣德日前又指定考纪会开会处理该案，不但是继续无视必须先行经过花莲县考纪会和县党部的程序，而且直接指令考纪会开会时间的做法也是“史无前例”，引发党内不满。反对人士认为，傅行事争议大、纪录不良，这次与国民党推举的候选人黄启嘉争选“立委”，中伤党形象。
马英九虽未出面，但核心幕僚兼战友金溥聪、子弟兵台北市议员徐巧芯、国民党青年团前总团长林家兴等人都表态反对，形同马、金联手断傅党籍路。
傅崐萁恢复党籍案甚至影响到国民党接下来的党主席选举。因为，包括代理党主席林荣德、“中常委”及国民党立法机构党团，还有党主席候选人郝龙斌等为一方，是支持傅崐萁重返国民党，希望能借助傅的能力，以增强党团的战力；而国民党党内的马英九系统，另一位党主席候选人江启臣及其背后的中生代，则反对恢复傅崐萁的党籍。
国民党在败选后不思进取，反而大搞党内斗争，其再起的机会着实渺茫。
