继严管岛内公务员在大陆转机后，台当局又针对“中科院”涉密人员经港澳转机，制定更严格的规范。
据台湾“中央社”29日报道，台“立法院”5月曾修正“国家机密保护法”，将退伍、离职涉密人员的列管年限增加到6年，以借此强化保密作为。民进党“立委”赵天麟日前质询时称，“中科院”有15名涉及机密业务的军文职人员，被披露曾在香港转机，“置国安于不顾”。“国防部”此前曾解释称，这15人并未入境，因此未违反管制规定，没有涉及“国安”的问题。28日，“国防部”和“中科院”被爆分别制定“从事国防事务现职及退离职人员申请进入大陆地区作业规定”及“中科院赴陆管制作业规定”，要求对于申请进入港澳地区转机应该制定更为严谨的规范。
台公务员和政务人员、地方首长自2006年起进入大陆地区就需事先申请，除了经主管机关同意，还要向“内政部”递交申请表，事后填写赴大陆地区返台意见反映表。蔡英文当局上台后对两岸交流严加管制，曾修法禁止退役将领等军公教人员登陆进行有政治意味的活动等。今年9月新修正的规定中，申请登陆的理由除了探亲、业务交流、主管机关同意出席项目活动等，还新增转机、搭船，无论入境还是不入境的转机，均要事先申请许可或报备。有分析称，台湾人出入境转机的情况十分普遍，一来是受限于直航有限，二来是转机比直航机票便宜。而这些转机多半只停留数十分钟或数小时，最多过夜，很难在这短时间里交付什么机密或者会见对岸党政人士。
