郭台铭宣布弃选2020，郭柯合作形同破功，柯文哲也被视为遭到“抛弃”。联署登记参选台湾地区领导人选举日期虽已在9月17日截止，但仍想参选的人仍有“政党推荐”一途。据台湾“中时电子报”报道，对于外界询问是否会与亲民党合作争取政党推荐参选2020台湾地区领导人，台北市长柯文哲表示会跟亲民党合作，“但要看合作什么”。
根据台湾当局有关规定，因亲民党在上一次（2016年）大选中，政党票得票率超过5%，此次（2020年）大选可推荐人选参与大选，不必登记联署。
柯文哲表示，幕僚为了他参选2020台湾地区领导人与否分成两派意见，50岁以下的反对、50岁以上的支持。对于丁守中预言他会向去年市长选举一样操作弃保，还会寻求透过政党推荐参选，柯则以“你没有说我都忘了”带过，但柯文哲话锋一转表示，宋楚瑜和他私交很好，也常常聊天，但“说到合作，要看合作什么”。
至于郭台铭是否因为自己婉拒出任副手才转而寻找前台东县长黄健庭，柯则表示并不清楚。至于“立委”部分是否会和郭台铭合作，柯文哲直言，他都不知到郭下一步动作是什么。
由于郭台铭退选势必让台湾民众党失去“母鸡”，柯文哲叹口气表示“小鸡要自立自强，不然怎么办？”不过，柯文哲并不否认因此动摇到台湾民众党的基层参选意愿与士气。
陈水扁预测台湾地区2020大选选情表示，郭台铭参选绝对不会当选，但柯文哲当选机率比较大。柯对此回应，从选战的技术来看，他的当选机会很大，但问题是用一百年的历史来看，这样好吗？柯文哲还称许阿扁“头脑清楚，讲选举头头是道”。
