据台湾媒体报道，台“教育部长”吴茂昆在“国科会主委”任内到大陆杭州参加高新技术高峰论坛，日前遭国民党“立委”柯志恩爆料未依法申请，吴响应若违法就下台，台“科技部”则表示无相关资料可核实，间接证实吴未申请。柯志恩昨进一步出示当年“行政院”发给“国科会”的函文，显示“行政院”未同意吴茂昆的杭州行，质问“行政院”发言人徐国勇“还要再辩护什么吗？”但“教育部”则未响应。
据报道，吴茂昆前天赴“立法院”备质询时，柯志恩指吴2005年曾到大陆苏州参加国际科学理事会，接着去未经申请的杭州高新技术高峰论坛，有违“台湾地区公务员及特定身份人员进入大陆地区许可办法”。吴响应若违法就下台，之后又改口，“那就看‘院长’要不要我下台”。“科技部”前晚响应，上述杭州行程“未有相关资料可资核实”，会洽“教育部”提供说明。
柯志恩昨根据“行政院”函指出，吴茂昆当年向“行政院”呈报10月17日至23日赴上海及苏州举办的国际科学理事会第28届大会，以及赴杭州参加高科技论坛高峰会。但“行政院”只同意10月17日至21日的国际科学理事会年会。
换言之，台“行政院”并未同意“高新技术高峰论坛”，因为依当时“法令”规定，政务官不能参加大陆所举办的非国际组织会议或活动。
“吴茂昆明确违法！”柯志恩说，吴茂昆无视“法令”和“行政院”的公文，私下以美国国家科学院海外院士头衔前往。
