蔡英文、陈菊、赖清德三人关系微妙（图源：观察者网）
台当局立法机构开议期间，周二、周五举行“院会”，台行政机构负责人总质询也安排在这二天。赖清德9月26日首度赴立法机构报告施政方针并备询，就石破天惊公开宣示“我是主张“台独”的政治工作者”。蔡办随即展开灭火，据知情人士指出，高雄市长陈菊当天北上与赖晤面，蔡英文与陈菊联手，硬是把赖清德压下来。
据香港中评社报道，赖清德当天的“台独”言论，蔡英文事先并不知情，包括党内都很意外，才有事后一连串的灭火。9月26日当天晚上台当局发言人林鹤明回应“....致力维系两岸和平稳定关系，也本于尊重历史及求同存异的精神，向对岸持续释出善意，期盼透过双方良性互动，逐步化解对立和分歧。”明显给赖很难堪。
陈菊一般是周三民进党中常会才会北上，9月26日当天周二就到台北来。据指出，她与赖清德见面时，特别提到两岸关系严峻，提醒赖把握两岸的发言，沟通之下，赖也听了进去。
赖清德妄言之后，中央政府国台办27日回应强调“台湾从来就不是个国家，永远不可能成为国家，搞‘台独’分裂必将自食恶果。”美国国务院27日重申美国的“一中政策，鼓励两岸对话，以双方人民都可接受的方式，和平解决分歧。”经过美中强烈的震荡，赖清德29日周五再度到台立法机构备询时就改口、放软，强调台当局“未来两岸的政策当然要服从蔡英文的领导”。
