台湾大学政治系教授张亚中日前投书媒体指出，蔡英文任命“独派”出任岛内文化、教育部门高官，继而迈出“文化台独”又一步。蔡英文此举使自己对于两岸关系的“善意”谈话几乎失去意义，也让两岸关系更险峻了。
张亚中在文中指出，郑丽君即将任“文化部长”。这位“内阁”中最年轻的“部长”，也是意识形态上最“独”的“部长”。近年来，民进党内对历史课纲问题着墨最深、动作最大的“立委”，郑丽君绝对可以排第一。就在她公布为“文化部长”前几天，还跟几位“独派”学者一起，要求马英九当局立即撤废微调课纲。在郑丽君主政下的“文化部”，很可能是“文化台独”的急先锋。
此外，潘文忠在“教改”与“独派团体”的支持下，击败台大副校长陈良基出任“教育部长”。张亚中说，这两位“文化台独”倾向甚明的人士担任“部长”，预示了未来蔡英文新当局文化及教育的主旋律，“去中国化”的脚步不会停止。可以断言，无论蔡英文未来在政治上或口头上做多少妥协与修饰，但“文化台独”的政策走向已箭在弦上。当两岸的认同彻底断裂之后，两岸的和平也就失去最重要的“地基”。
另据中评社报道，对于近年岛内绿营一直推动的“去中国化”，台湾大学心理系教授黄光国今4日指出，中国文化对于台湾民众来说根本无法完全抹除，这样做只是“自我阉割”。他表示，蔡英文当局上台后若要推行新课纲，自己会推动立一个慰安妇“小桃阿嬷”的铜像在“总统府”前，“要蔡英文好好想想小桃阿嬷到底是不是自愿（当慰安妇）的？”
适逢五四运动周年纪念，黄光国集结台湾学术界菁英，在台北宣布成立“文化中国论坛社”，誓言要“重振台湾精神，复兴文化中国”，并举办“呼唤青年心中的文化中国”座谈会。
