在这起事件中，台湾“外交部”的态度变化引发媒体质疑。针对“施行细则”第三条被删，“外交部领务局长”龚中诚仅表示尊重新“国会”的决定，因为过去有案例显示民众贴“台湾国贴纸”入境新加坡时遭遣返，他身为事务官员，有责任善意提醒，“希望护照不要变成争议性东西”，但如果多数民意觉得不是问题，他表示尊重。《中国时报》7日评论称，“外交部”之前为捍卫“护照规定”，不断强调台湾人持用变更封面“护照”恐被他国海关遣返，更可能危及160多个国家和地区的免签待遇;但如今却放任绿营“立委”删改规定，甚至在修正案条文尚未送“院会”审议就先行通知“移民署”立即生效，且对贴贴纸者不再搜集个人情报，“过去的果断态度仿若已无影无踪？难不成遇上台独都变合法化？外交部也变得太快、太软弱了!”
台湾“护照”因为所谓加注问题曾多次引发争议。2002年，陈水扁时期的“外交部长”田弘茂提议在“护照”上加注“issued by Taiwan”(台湾发行)字样，有人批评陈水扁当局变相推动“台独”，还有人认为有矮化台湾成“地方政府”之嫌。2003年9月，新版“护照”封面进行了改动，在“中华民国”下加注“台湾”字样。2012年12月，民进党印制1万份与正版“护照”尺寸一样的“Taiwan is my country”(“台湾是我的国家”)贴纸发送民众，贴在“护照”封面。贴纸清楚标着台湾与菲律宾、越南和中国大陆等周边地区的相对位置，宣传台湾与大陆是“一边一国”。如今绿营又为“台湾国护照贴纸”开绿灯，同样在岛内引发巨大争议。台驻美代表沈吕巡称，“台湾国贴纸”恐涉及信息造假，影响“护照”真实性，不利于入境美国。还有民众表示，不能放任越来越多的人挑战政府效能，“千万不可姑息畸形的民主”。
与此同时，持“台湾国贴纸护照”不断传出被拒绝入境的消息。去年年底，有台湾民众入境新加坡时遭遣返，其中2人虽然表明愿意撕下贴纸，但还是被新加坡海关拒绝入境。美国执法官明确告诉台驻美代表处，把“台湾国”贴纸贴在“护照”封面，不仅会给游客个人带来大麻烦，而且有可能影响到全台湾民众的免签待遇。《中国时报》7日称，绿营积极要求删除相关规定，无非是投部分选民所好，未来台湾人若被遣返后果可以自负，但如果影响整体民众160余国和地区的免签待遇，损失如何弥补。况且根据“刑法”规定，伪造、变造“护照”须负刑责，“外交部岂能弃守立场？今日改护照条例施行细则，容许国人变造护照封面，那他日是否允许国人以相同理由改造身份证、驾照？立法诸公修法时，岂可不慎”。【环球时报驻台北特约记者 陈明宇】
