2历史最久的战机联队驻防 配备70架“经国号”战机
如今台南机场，承担军民两用兼顾的角色，场站由台军方管理，包含军用的台南基地和民用的台南航空站。
在民用航空方面，高雄国际机场1965年7月1日投入运营之后，台南机场不再担任国际线的辅助机场任务，仅有岛内航线。其全盛期是在1997年，当时全年载运量近250万人次，有台北、花莲、台东、马公、金门航线。但随都会台铁环岛铁路网建构完善,特别是2007年台北至高雄的高铁通车后，台湾西岸航空业全面失去竞争力，至2013年，台南机场定期航线班机仅有澎湖、金门两条航线，年载运量仅有全盛期的九分之一。台南机场目前也是服务两岸直航的机场之一。
在军用方面，台南机场驻扎了台湾空军历史最悠久的战斗机联队——“第一战术战斗机联队”（原第443战术战斗机联队）。台军目前有126架IDF“经国号”战机，除台中清泉岗第三联队配备56架外,其余70架都驻防在台南的第一联队。
台湾空军“第一战术战斗机联队”的前身，是由美空军直接协助改制后的国民党当局“空军第一联队”，最早在武汉成立，所属部队参加过抗日战争。这支部队如今除了驻守台南基地外，还与台中的“第三联队”轮换进驻澎湖马公基地的“天驹部队”。
由于台南基地曾是越战期间美军军机转移的重要维修基地之一，因此，目前的台南基地也是台湾航空器维修商“亚洲航空”总部，维修基地面积约5.57平方公里。上个月，为了展示战机维修能力，台军还公开10架战机一起维修的画面。
此外，台南基地还驻有隶属于台当局“内政部”的空中勤务总队第三大队第一中队，配备AS365及UH-60M黑鹰直升机,负责南台湾陆海空的救灾、救难、救护、观测侦巡、运输等任务。
