二、中央开展反对“两国论”斗争
鉴于李登辉抛出“两国论”的严重危害及其恶劣影响，面对岛内“台独”分裂势力的严重挑衅，中央迅即开展坚决反对李登辉“两国论”的斗争，打击台湾分裂势力的嚣张气焰。
这场斗争事关国家主权与领土完整、事关祖国和平统一大业，是一场带有战略意义的重大战役。这场斗争的结果，将决定我们最终解决台湾问题的方式。这场斗争分为三个阶段。
第一阶段，揭露李登辉”两国论“的本质、图谋及危害，郑重表达祖国大陆维护国家主权和领土完整的严正立场。
7月12日，中共中央台办、国务院台办发言人发表谈话指出：李登辉公然将两岸关系歪曲为“国与国的关系”，再一次暴露了他一贯蓄意分裂中国领土和主权、妄图把台湾从中国分裂出去的政治本质，与“台独”分裂势力的主张沆瀣一气，在分裂祖国的道路上越走越远；严正警告台湾分裂势力立即悬崖勒马，放弃玩火行动，停止一切分裂活动。
同一天，海协会长汪道涵、外交部发言人也分别发表谈话。汪会长表示，一个中国原则是两岸关系发展的基础，也是海协与海基会受权进行相互联系、对话与商谈的基础。汪会长对台湾媒体报道的海基会董事长辜振甫先生关于两会会谈就是“国与国会谈”的说法感到惊讶，希望其予以澄清。外交部发言人则表示，李登辉图谋在国际上制造“两个中国”、“一中一台”，直至竞敢冒天下之大不韪，将两岸关系定位为“国与国关系”，这必然严重影响两岸关系的改善，影响台海局势的稳定，危害中国的和平统一。
7月18日江泽民主席与美国总统克林顿通话，指出：中国政府和人民对李登辉的分裂言论作出反应，这体现了中国政府和中国人民反对分裂、捍卫国家主权和领土完整的坚定决心。在台湾问题上，我们不承诺放弃使用武力。如果出现搞“台湾独立”和外国势力干涉中国统一的情况，我们绝不会坐视不管。江泽民主席与克林顿总统通话，充分表达了中国政府和中国人民反对分裂、捍卫国家主权和领土完整的坚定决心，表达了中国共产党人始终把国家统一作为自己奋斗目标的历史使命，表达了中华儿女在祖国统一问题上的坚强意志。克林顿在通话中重申美国政府对一个中国政策的坚定承诺，强调美国在台湾问题上的政策没有改变，美中两国关系十分重要，不能受到破坏。
第二阶段的斗争目标是阻止“两国论”“入宪”、“入法”，制止李登辉的法理“台独”。
按照李登辉最初的如意算盘，提出“两国论”只是第一步，接下来第二步就是按照“两国论”“修宪”“修法”。他密谋启动“国代延任案”，并借机制定所谓“台湾基本法”就是一个值得高度警惕的动向。9月4日，李登辉操纵国民党联手民进党“三届国代”通过所谓“延任案”，由“国大代表”自己将自己的任期由原来的2000年5月延长至2002年6月。并由延长任期的“国代”在延任后的两年时间里制定一部所谓“台湾基本法”或“根本大法”。民进党予以密切配合，随即在9月7日成立了“新宪法工作小组”，计划在李登辉卸任前推动“基本法”起草并争取通过。
在江泽民主席与克林顿总统通话后两天，经中央批准，中共中央台办、国务院台办负责人发表了坚决反对台湾分裂势力按“两国论”“修宪”、“修法”的谈话。谈话指出：“目前，特别值得注意和警惕的是，台湾分裂势力正企图按照‘两国论’修改台湾地区的所谓‘宪法’和‘法律’，以所谓‘中华民国’的名义实现‘台湾独立’。”谈话严正指出：“如果这一图谋得逞，中国和平统一将变得不可能。”
在我斗争的强大压力下，台湾方面陆委会负责人随即公开表示“两国论”不“入宪”。事后，李登辉在其《李登辉执政告白实录》一书中坦承：“对于‘特殊国与国关系’，经由修宪、修法加以落实的问题，随着时间的推移，国内、两岸、国际情势不断演变下，李登辉盱衡全局，逐渐做出了通盘的思考，约在8月中旬不得不考虑现实问题，决定放弃原议。”该书承认，中共中央台办、国务院台办负责人关于“如果台湾方面根据两国论修宪、修法，‘和平统一’将变得不可能，这个说法对‘国大’凝聚共识具有相当的干扰效果”。
第三阶段的斗争目标转入为进入新世纪的两岸关系明方向、划底线。
2000年伊始，在不到两个月的时间里，祖国大陆方面相继发表了两个对台重要讲话和一份政府文件。1月1日，江泽民主席在全国政协新年茶话会上发表重要讲话，重申“在一个中国原则的基础上进行两岸的对话与谈判”。表示：“台湾是中国领土一部分的地位是不能改变的。我们坚持‘和平统一、一国两制’的方针没有改变。我在五年前提出的发展两岸关系、推进祖国和平统一进程的八项主张没有改变。”这三个“没有改变”，表达了全体中国人民在台湾问题上的立场和决心，为进入新世纪的对台工作和两岸关系指明方向。28日，钱其琛副总理在纪念江泽民主席八项主张发表五周年座谈会上发表重要讲话，阐述了对当前两关系中主要问题的主张。这一讲话具体化了“什么问题都可以谈”的内容，提出“可以谈正式结束敌对状态问题，谈两岸同胞盼望已久的直接‘三通’问题，谈双方加入世界贸易组织后的经贸关系等相关问题，谈台湾在国际上与其身份相适应的经济、文化、社会活动空间问题，也可以谈台湾当局的政治地位问题。”2月21日，根据中央领导同志的指示精神，国台办、国务院新闻办发表《一个中国的原则与台湾问题》白皮书，用政府文件的形式系统全面地阐述了中国政府关于坚持一个中国原则的立场和政策。表明祖国大陆反对“两国论”、反对“台独”的坚定决心。白皮书强调了一个中国原则与和平统一方针的内在联系，驳斥了由台湾居民“公民投票”决定台湾前途的主张，详细论述了台湾问题的解决不适用“两德模式”，并昭告世界：如果出现台湾被以任何名义从中国分割出去的重大事变，如果出现外国侵占台湾，如果台湾当局无限期地拒绝通过谈判和平解决两岸统一问题，中国政府只能被迫采取一切可能的断然措施、包括使用武力，来维护中国的主权和领土完整，完成中国的统一大业。这三个重要讲话和文件非常清楚地传达了这样的信息：中国政府坚持“和平统一、一国两制”的基本方针，继续贯彻江泽民主席提出的发展两岸关系、推进祖国和平统一进程的八项主张，将继续尽最大努力争取和平统一，同时，中国政府维护国家统一、主权与领土完整的决心是坚定不移的，绝不会允许任何势力以任何方式把台湾从中国分割出去。这三个重要讲话和文件在台湾和国际社会产生了强烈反响，引起舆论广泛关注。
在开展反对李登辉“两国论”斗争期间，祖国大陆媒体发表了一大批各界撰写的批判、揭露李登辉及其“两国论”的理论文章、新闻评论和时事评析，全面报告了祖国大陆为推进两岸关系发展和促进祖国和平统一所做的努力，系统地清理了李登辉上台以来推行的“台独”分裂言论，揭批李登辉“两国论”等一系列分裂主张的实质。
在这场斗争中，军队在中央领导下，采取对台军事威慑行动，起了至关重要的作用。7月31日，在庆祝中国人民解放军建军72周年招待会上，中央军委副主席、国防部部长迟浩田表示，中国人民解放军严正以待，时刻准备捍卫国家的主权和领土完整，坚决粉碎任何分裂祖国的图谋。8、9月间人民解放军接连举行一系列大规模军事演习，显示了维护国家主权和领土完整的强坚强意志和巨大能力。
