保生大帝信仰源于福建，王文宗及其同仁，长期以来一直怀揣着回到祖宫朝拜的愿望。据王文宗回忆，早在30年前，两岸刚开放探亲时，台南学甲慈济宫董监事便组团回到漳州白礁慈济宫祖庙参访。当时，看到祖宫设施需要修缮养护，他们立即募款120万人民币协助整修，这在当时可不是个小数目。1991年，在台南学甲慈济宫的努力之下，大陆宗教人士获准赴台，开启了两岸宗教文化双向交流的第一次尝试，两岸保生大帝信仰交流得到了极大地推动。
王文宗本人2008年第一次前往福建寻根谒祖，从此以后，他每年都会回白礁和青礁祖宫参拜进香，表达对先祖的崇敬之情。每年，厦门举办两岸保生慈济文化旅游节，台南学界慈济宫也会派员到青礁慈济宫祖宫，共同祭拜保生大帝。
台南学甲慈济宫董事长 王文宗：我们现在也在组织青年团、学生团（登陆交流）要让历史的传承大业，一定要一代一代把它传承下去。
2016年，民进党当局上台后，刻意阻扰两岸民间交流。身处被视为绿营大本营的台南，王文宗顶住压力，坚持举办两岸宗教学术交流活动。在他的大力推动之下，世界保生大帝庙宇联合总会于今年1月在台南学甲成立，成为联系世界各地两千多家保生大帝庙宇的重要平台。当天，来自世界各地的200多尊保生大帝神像在此安座，创下同一时间最多保生大帝神尊齐聚的纪录。典礼现场，厦门青礁慈济宫、漳州白礁慈济宫、泉州花桥慈济宫3家祖宫受聘担任荣誉总会长宫，并居于指导位阶，而应邀加入运作的大陆宫庙也多达64间。在王文宗看来，两岸信仰根源同出一脉，不该受政治问题干扰。
台南学甲慈济宫董事长 王文宗：我们在台南这个地方，你谈到两岸的话会特别艰辛，很容易就被人家打压。但是秉持一个中国人的良知，我们对祖国、对中华民族伟大复兴的殷切期盼，我们也克服了很多困难跟障碍。
眼下，王文宗正在筹建保生大帝宗教纪念园区。他打算立一座20米高的保生大帝石雕神像，面向大陆，与大陆白礁祖宫遥望。王文宗说，这象征着牵起两岸的情谊，在台湾岛内是绝无仅有的。
台南学甲慈济宫董事长 王文宗：告诉我们的后代子孙，我们跟大陆血脉相连，都是中华儿女，也都是一家人，这样一个概念。
