清淤先从围堰抽水着手
按照施工流程，琴亭湖清淤将首先进行围堰抽水，即进行湖区围堰。
目前，整个湖的水都是排到晋安河中，晋安河的水位原先比琴亭湖低，但外面施工导致晋安河的沉淀也较厉害，现在水位基本和琴亭湖一致，清淤主要任务还是排水，把水位降下来难度比较大，目前正做降水和抽水工作。
抽干湖水后，施工方将继续湖体施工便道建设，以便施工机械进入湖区。之后，还计划沿着建发领第楼盘旁的湖体驳岸边做一条导流渠，将解放溪上面的河流下来的水，引到导流渠中，再通过排水闸排掉，将水引走，方便机械施工。
淤泥通过渣土车外运，清淤过程中需要对驳岸进行加固保护，需要对施工驳岸两边2米范围内打木桩和抛石。同时为减少施工队对周边影响，将进行环湖围挡。
按照初步设计，此次清淤量约为8万立方米，目前洗车池正在建设中，以便运送淤泥时，清淤车辆出入不会对环境造成影响。
由于清淤和做导流渠都是在水里作业，难免对湖体淤泥土产生扰动，湖体里的湖水会产生一定影响（浑浊），会造成下游（晋安河）方向水质有一定影响，清完淤后水质将大大提高。
