清代，闽南一带的武术各立门户，太祖拳也逐步产生变化，由方七娘（小说中的吕四娘）所创的白鹤拳自立一系，在闽南南少林的五形拳也演变成为五大主要拳种门派；1、达摩；2、太祖；3、罗汉；4、行者；5、白鹤等，诸派风格稍异，而拳法混同。清未蔡玉鸣（1853-1910，福建泉州南门外晋江梧塘冯尾村人）以太祖拳为基本功底，综合其他门派拳法的特点而形成五祖拳，又称五祖鹤阳拳，蔡玉鸣是该门派的创始人。
清末民初，蔡玉鸣的弟子沈扬德到新垵，收邱剑刚为徒，在新垵邱氏宗族创立海瀚角武馆、上宅角武馆、东社角武馆、大门前角武馆、下堂庵角武馆、大岑角武馆等六个武馆，立堂号为“鹤阳堂”， 馆名：“新江国术馆”，创办了“玉明武术研究会”，整理了三战教授法及新编“新八法”，从此五祖拳在厦门及新垵开始流传下来。当时新垵有闽南出名的武术家邱思志（大舍）、邱剑刚（乌铁师）、邱衡煌、何苏武、邱加注、邱继仕、邱天乞、蔡瑞全、邱思炭等，号称沈阳德门下“十大虎将”。抗日战争期间，他们分别是1937年,抗日战争爆发，日军占领了厦门, 沈扬德被迫出洋，其弟子也星散在闽南一带设馆传徒。1947年，邱思炭主持新垵武馆，重兴五祖拳鹤阳馆和“新垵玉明武术研究社”，从而推进了新垵武术事业的发展。1964年10月1日，新垵村成立了“玉明武术新垵村研究社”，邱思炭弟子邱跃土（时任村长）出任馆长。文革期间，新垵村有志青年也从未间断练武，自70年代起在省级的各项比赛中不断获得佳绩。新垵从此成为著名的武术之乡。
五祖拳拳术套路内容十分丰富，各套路拳法既能徒手单练又能徒手对练，具有攻防技击意义的操练方式，也能按拳种的风格使弄各种古兵器，如：川耙、钗、月牙枪铲、方天画戟、齐眉棍、丈二棍、朴刀、宫刀、开山大斧、柳叶刀、剑、双锏、双铁鞭、三节棍、柳公拐等长短兵器，还有民间常有的器具，如：锄头、雨伞、板凳、扁担等。
